软件介绍
MarvinSketch是一个专业的化学分子图辅助工具,可以帮助用户绘制,编辑,发布,渲染,导入和导出化学结构,并可以在各种化学和图形文件格式之间进行转换。内置的结构和化合价检查器,集成了属性计算器以根据您的要求提供实时结果。如此强大的工具还是开源免费的,可用于个人,学术和非商业用途。
软件特色
1、丰富的编辑
易于使用的化学绘图功能,很多快捷方式;
方便的2D和3D编辑;
2D和3D清洁结构;
预定义的结构模板和用户定义的自定义模板;
缩略组;
可以将化学名称(IUPAC或传统名称),CAS RegistryNumbers?或InChi / RInChI粘贴到画布上,然后直接转换为化学结构 ;
支持多种文件类型:MRV,CDX,SKC,SDF,RDF(V2000 / V3000),RXN,MOL,MOL2,SMILES,SMARTS,InChI / RInChI,CML,FASTA 等;
在不同的化学编辑器之间复制和粘贴;拖放功能;
将可编辑的化学结构(如Marvin OLE对象)插入MS Office文档中;
先进的查询功能;
处理聚合物和生物分子;
用户可定义的可定制样式(字体,颜色,结构表示等);
绘制和格式化形状,箭头和文本框;
多页文档和打印支持。
2、化学意识
同位素,电荷,自由基,孤对和别名;
错误检查(价错误和结构检查);
先进的立体化学功能;
基于结构的计算器插件 -用于计算不同的化学性质-可以直接从MarvinSketch调用;
结构查询设计(R-logic,SMARTS属性等);
手动和自动绘制反应图;
3、跨板交付
Marvin可以在所有主要操作系统上运行;
.NET软件包可用于将MarvinSketch集成到.NET应用程序中。
使用说明
1、在MarvinSketch中绘图
要将原子放置在画布上,请从“原子工具栏”中选择一个原子,或键入其化学符号,然后单击鼠标左键将其放置在画布上。
要绘制单键,点击单个债券按钮图片/下载/附件/1805257/Single_Bond_Icon.png上的工具栏,并放置在画布上的单键。可以选择默认单键以外的其他键类型。要选择其他类型,只需单击▼按钮即可打开下拉列表。
债券下拉列表
您也可以通过此菜单,上下文菜单(Type)或使用键盘快捷键来更改画布上的现有键。有关快捷方式的更多信息,请参见MarvinSketch中的快捷方式。
要绘制链,请单击“工具”工具栏上的“绘制链”按钮,然后在画布上拖动。图片/下载/附件/1805257/Chain_Icon.png
要将模板放置在画布上,请从“高级模板”工具栏中选择一个模板,然后单击画布。按住鼠标左键并拖动可以旋转模板。
要增加或减少电荷,请单击“工具”工具栏上的图片/下载/附件/1805257/Plus_Charge_Icon.png或图片/下载/附件/1805257/Minus_Charge_Icon.png按钮,然后单击所需的原子。另外,您可以通过将光标悬停在原子上并按+或-键来设置原子的电荷。
2、在MarvinSketch中选择
MarvinSketch中有不同的选择工具。这些如下:
矩形选择:默认选择工具。准备好时,按住鼠标左键选择并释放按钮。
套索选择:按住鼠标左键,然后在片段周围移动光标。准备好选择后,松开按钮。
结构选择:单击结构的任何原子以选择整个结构。
可以通过下拉列表选择套索选择和结构选择。
要选择原子,键或组,请使用“矩形选择”或“套索选择”模式(单击,图形选择区域)。
要选择结构,请使用“矩形选择”或“套索选择”模式(双击其任何原子或键),或使用“结构选择”(单击两次)。
要向选择中添加更多部分或删除选择中的部分,请在单击所需部分的同时按住Shift键。
例如,要反转选择,请选择以前未选择的所有内容,请使用“编辑”>“反转选择”(Ctrl+Shift+I)。如果在画布上未选择任何内容,则此操作将选择画布上的所有内容。
要取消选择,请单击画布的空白处。
3、在MarvinSketch中删除
要删除原子或键,请从“常规”工具栏中选择“擦除”工具,然后单击要删除的原子或键。也可以通过拖动选择删除区域。同样,可以通过“编辑”>“删除”或通过上下文菜单使用删除功能。
您也可以通过单击“擦除”按钮或按Delete键来删除以前选择的区域。
4、移动旋转缩放比例
移动
要移动原子,请在任何选择模式下用鼠标将其拖动。
要移动选择,请按一次空格键或将光标向中心移动,直到出现一个蓝色矩形,并按住鼠标左键拖动。
旋转
要以2D旋转选区,请按两次Space键或将光标移到选区上直到出现蓝色的旋转符号,并按住鼠标左键拖动。
要以3D旋转选区,请按空格键三下,或导航至“编辑”>“变换”>“以3D旋转”,然后从选项中进行选择,并按住鼠标左键拖动。
放大
有几种方法可以放大和缩小。这些是以下内容:
按住Ctrl并使用鼠标滚轮。
使用常规工具栏上的缩放按钮。
通过使用下拉列表或导航到“视图”>“缩放级别”来指定缩放百分比。将值设置为“全部”可将对象放大或缩小到画布的整个大小。
缩放下拉列表
按F6并垂直拖动以缩放。
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